Die Welt ist von einer tödlichen Krankheit namens Medusa bedroht, die sich rasend schnell ausbreitet. Die Zellen der Infizierten fangen an zu »versteinern« und kurze Zeit später tritt der Tod ein.
Auch das Mädchen Kasumi ist infiziert. Zusammen mit einer Gruppe ausgewählter Patienten wird sie in eine Art Tiefschlaf versetzt, bis ein Gegenmittel gefunden ist. Aber als die Gruppe unerwartet erwacht, ist nichts mehr, wie es war: Alles ist von Dornengewächsen überwuchert und urzeitliche Kreaturen bevölkern die Erde. Um in dieser Welt überleben zu können, muss Kasumi herausfinden, was zu der Katastrophe geführt hat. Dabei stößt sie auf unzählige Mysterien und eine gigantische Verschwörung...